کریم باقری، شش ماه پس از تمدیدنشدن قراردادش با پرسپولیس در گفتگو با اپلیکیشن فوتبال ۳۶۰ و پژمان جمشیدی ادعا کرده که با دستور بخش امنیتی، از کادر فنی پرسپولیس کنار گذاشته شده است.
این بازیکن بازنشسته تیم ملی فوتبال ایران گفت: «باشگاه پرسپولیس تماسی با من برای قرارداد نگرفت و فکر کنم مسائل بیرونی باعث شد نباشم. بخش امنیتی گفتند من فعلا در پرسپولیس کار نکنم.»
در تیرماه سال جاری، بحث کنار گذاشتن کریم باقری از کادر فنی پرسپولیس در رسانه‌ها مطرح شده بود و ادعا شد که قرارداد او به دلیل حمایت این مربی سرشناس پرسپولیس از ناآرامی‌های زن ، زندگی ، آزادی تمدید نشد.
هرچند یحیی گل‌محمدی بارها حمایت خود از کریم باقری را اعلام کرد، اما رضا درویش گفت قرارداد دستیار سرمربی پرسپولیس تمدید نمی‌شود. او در یکی از دلیل‌تراشی‌ها برای حذف باقری گفته بود که «کریم باقری خودش تمایل آنچنانی به ادامه کار نداشت و دوست داشت دنبال کارهای اقتصادی برود!»
باقری چنین ادعایی را دوباره رد کرده است. رستوران منتسب به کریم باقری نیز طبق اخبار شبکه‌های اجتماعی چند بار پلمب شد.
