کلیات
دوران حرفه ای
ویلموتس اولین بازی ملیاش را برای تیم ملی فوتبال بلژیک در تاریخ ۲۶ مه ۱۹۹۰ میلادی مقابل تیم ملی فوتبال رومانی انجام داد. او در ۷۰ بازی ملی حضور داشت و جمعاً ۴۹۴۷ دقیقه برای تیم ملی فوتبال بلژیک به میدان رفت. مارک ویلموتس آخرین بازی ملی خود را در تاریخ ۱۷ ژوئن ۲۰۰۲ میلادی در برابر تیم ملی فوتبال برزیل انجام داد. وی در بازیهای ملیاش ۲۹ گل به ثمر رساند.
امضای قرارداد با تیم ملی ایران
روز چهارشنبه ۱ خرداد ۱۳۹۸، سفارت ایران در بلژیک خبرداد که مهدی تاج رئیس فدراسیون فوتبال قرار داد سرمربی گری تیم ملی ایران را با مارک ویلموتس تا پایان جام جهانی ۲۰۲۲ به امضا رساند.
مارک ویلموتس روز چهارشنه هشتم خردادماه با حضور در تهران و در قالب یک نشست خبری رسماً آغاز به کار خود در تیم ملی فوتبال ایران را اعلام کرد. او ضمن تأکید بر تلاش برای موفقیت در جام جهانی و جام ملت ها اعلام کرد که وحید هاشمیان را به عنوان دستیار ایرانی خود انتخاب کرده است.
احتمال فسخ قرارداد
در تاریخ ۱۴ آبان ۱۳۹۸ تابناک ورزشی از احتمال فسخ قرارداد ویلموتس با ایران به دلیل مشکلات ارزی و مالی ناشی از تحریم ها خبر داد. با این همه مشکل مالی فدراسیون فوتبال با ویلموتس به صورت موقت حل و وی به ایران بازگشت.
قرارداد ویلموتس
گفته می شود قرارداد مارک ویلموتس با تیم ملی ایران سالانه سه و نیم میلیون یورو است. مهدی تاج در مورد بندهای قرار داد ویلموتس گفته است که از بندهای قرارداد کارلوس کی روش بیشتر است.
کارشناسان از عدم حضور پیوسته ویلموتس در کنار تیم ملی ایران گلایه مندند. قرار بر این بود که بعد از بازی با تیم ملی عراق در بازی های مقدماتی جام جهانی قطر، کنفرانسی برگزار شود و به صورت مشخص در مورد قرار داد سرمربی تیم ملی (مارک ویلموتس) توضیح داده شود، اما این اتفاق رخ نداد.